مسيرة
        مستمرة
   من الدعم التنموي
           في فلسطين

تعتبر الجمعية العمومية لمؤسسة التعاون السلطة العليا في المؤسسة حيث تضم أكثر من 100 عضواً يشكلون نخبة من رجال الأعمال والمفكرين العرب والفلسطينيين. وتعقد الجمعية اجتماعاً سنوياً لمراجعة عمل المؤسسة وإقرار استراتيجياتها وخططها وميزانيتها.  ومجلس أمناء المؤسسة المكون من 43 عضواً وتنتخبه الجمعية العمومية كل ثلاث سنوات، يجتمع مرتين سنوياً لصياغة سياسات واستراتيجيات المؤسسة ولمراجعة أدائها.

يشرف مجلس الأمناء على أنشطة المؤسسة عبر هيئة إدارية منتخبة ولجان متخصصة للبرامج والمشروعات، وتنمية الموارد والاعلام، والاستثمار، العضوية، وغيرها من اللجان الفنية. تتكون اللجان من أعضاء من مجلس الأمناء والطاقم الإداري وعدد من الخبراء.

يتولى تنفيذ أعمال مؤسسة التعاون جهاز تنفيذي متمكن يضم حوالي 100 موظف، وبإشراف من المدير العام على أربع دوائر هي البحث والتخطيط، العمليات البرامجية، تنمية الموارد والاتصال والإعلام، والمالية والإدارة. وتتم الاستعانة في بعض المناسبات بخبراء إقليميين ودوليين لدعم عمل الجهاز التنفيذي إذا دعت الحاجة.